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撰文丨王聪
编辑丨王多鱼
排版丨水成文
近日,纳米孔基因测序领域先驱牛津纳米孔技术公司(ONT) 推出一种新的高通量台式DNA测序仪—— PromethION2 Solo ,该设备大约一本书大小,可提供快速且更低价格的高通量测序,它与更大的PromethION使用相同的测序硬件,PromethION运行24或48个测序芯片。而PromethION2 Solo 运行2个测序芯片,起售价为10455美元,牛津纳米孔表示,该设备可以以不到1000美元的价格提供完整人类基因组测序。如果批量操作并连接到牛津纳米孔的更大的流动池 (flow cell) 设备,可以将完整人类基因组测序的价格降至300-600美元之间。
牛津纳米孔表示,与该公司之前的PromethION一样,PromethION2 Solo 的两个测序芯片可以对短读长 (低至20个碱基) 和长读长 (超过400万个碱基) 的DNA或RNA进行测序,方便快捷地获得完成大型基因组、研究复杂宏基因组样本、从单细胞测序中获得已知和新的转录物等所需的数据,还能记录DNA甲基化和DNA结构变异。这款新设备的外形更小,价格更低,主要面向中小型学术和研究实验室以及商业服务提供商,可为样本测序要求较低的用户 (每周最多4次全长测序/每年约200张测序芯片) 提供高通量纳米孔测序的优势。
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PromethION2 Solo
目前,牛津纳米孔最小的设备是MinION,仅手掌大小,MinION可以直接连接笔记本电脑进行实时DNA或RNA测序。而PromethION2 Solo 相比MinION更为先进。
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MinION
此外,牛津纳米孔公司还在开发比PromethION2 Solo稍微大一点的PromethION2,并计划在未来几个月后上市。作为一种独立设备,PromethION2 具有机载数据分析和触摸屏显示功能。
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PromethION2 (左),PromethION2 Solo (右)
牛津纳米孔公司首席执行官Gordon Sanghera博士表示, 这款新设备的灵活性将帮助“任何人在任何地方”获取人类规模的基因组数据。这将为癌症研究、人类遗传学、传染病等研究带来更广泛的基础。
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